Les séminaires de statistique des doctorants

Les séminaires de statistique des doctorants à Rennes sont co-organisés par les doctorants en statistiques de l’Equipe de Statistique de l’Irmar et le Crest-Ensai. Ils se déroulent en alternance à Agrocampus Ouest et à l'Ensai chaque vendredi avant les séminaires hebdomadaires de statistique.

Programme détaillé
  • Vendredi 17 Octobre 10h00 Agrocampus-Ouest
Alia Dehman, laboratoire statistique et génome, Evry
 
Résumé
In genome-wide association studies, we are interested in finding genetic markers that are significantly associated with a phenotype of interest. Whole-genome single nucleotide poly- morphism (SNP) data are collected for many thousands of SNP markers, leading to high-dimensional regression problems where the number of predictors greatly exceeds the number of observations. Moreover, these predictors are highly dependent, in particular due to linkage disequilibrium (LD)
We propose an approach that explicitly takes advantage of the grouping structure induced by LD and we investigate the efficiency of this approach compared to state-of-the art regression methods (haplotype association, single-locus, Lasso and Elastic-Net). Our results on simulated, semi-simulated and real data illustrated the relevance of the proposed method and its robustness to a real linkage disequilibrium structure.
  • Vendredi 27 Mars 10h00 Ensai
Pierre-Alexandre Mattei, doctorant à l'Université Paris-Descartes (MAP5), Une relaxation continue du rasoir d’Ockham bayésien pour la régression en grande dimension.
 
Résumé
Nous considérons le problème de la régression parcimonieuse bayésienne. Dans ce cadre, un modèle génératif est proposé dans lequel un a priori de type spike-and-slab est supposé sur le paramètre de régression. Notre principale contribution consiste en l’utilisation d’une méthode d’inférence approchée basée sur une relaxation continue simple du modèle ainsi qu’un algorithme EM. Que ce soit sur données réelles ou simulées, l’approche choisie se révèle particulièrement efficace, tant en performances de prédiction que de sélection. Une nouvelle base de données de régression en grande dimension est également présentée : il s’agit de prédire le nombre de visiteurs du musée d’Orsay à une certaine heure en observant l’activité des 1200 stations Vélib’ de Paris.
Un paquet R implémentant l’algorithme spinyReg est en cours de développement et est accessible à l’adresse https://r-forge.r-project.org/projects/spinyreg.
Le papier concernant ce travail est celui-ci https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01003395.
 
  • Vendredi 3 Avril 9h30 Insa

Valérie Robert encadrée par Gilles Celeux et Christine Keribin, doctorante à l’Université Paris-Sud, Un modèle statistique pour la pharmacovigilance - Résumé

Emilie Devijver encadrée par Pascal Massart et Jean-Michel Poggi, doctorante à l’Université Paris-Sud, Classification de données de regression de grande dimension - Résumé
 
Accès à l'Ensai

L'Ensai est située sur le campus de Ker Lann à Bruz, au sud de Rennes en direction de Redon.

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Le campus est à vingt minutes en bus (lignes 57, 57/59 ou Ker Lann Express) de Rennes. Le départ du bus se fait à l'arrêt République-Rennes. Retrouvez tous les horaires sur www.star.fr.

> Téléchargez le plan d'accès à l'école.

Accès à Agrocampus Ouest

Le laboratoire de mathématiques appliquées - Agrocampus Ouest est situé dans Rennes, sur la rue de Saint-Brieuc.

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Responsables

Gaspar Massiot - IRMAR, ENS Rennes, LSM Crest-Ensai - website

Emeline Perthame - IRMAR, LMA2 - website

Vincent Audigier - IRMAR - UMR 6625 du CNRS, Agrocampus Ouest - website